1. Bảo quản tổ yến khô: Yến sào Phúc Yến là loại tổ yến khô, không bị phun nước trong quá trình vận chuyển, có màng bảo vệ bên ngoài. Đem tổ yến đựng trong hộp kín, bảo quản ở nơi khô ráo thoáng mát thì sẽ sử dụng được tới 2 năm.
2. Bảo quản tổ yến đã sơ chế/ chế biến (tổ yến đã ngâm nước hoặc chưng): Tổ yến chưng sẵn, sau khi để nguội có thể đựng trong hộp kín sạch sẽ, để trong tủ lạnh thì có thể bảo quản trong vòng 1 tuần. Không nên lắc hộp bảo quản vì sẽ làm yến nhanh bị hòa tan. Khi lấy yến để sử dụng, nên dùng thìa sạch khô nhằm hạn chế các vi khuẩn từ bên ngoài tiếp xúc với yến chưng, làm hỏng thực phẩm. Có thể sử dụng yến chưng cùng với sữa tươi hoặc trái cây.